RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 FGL1Q08830 312 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GALMQ96C23 342 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 EHFQ9NZC4 300 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 JPT1Q9UK76 154 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.51□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR5H14A6NHG9 310 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 M0QZ24 198 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC31A2O15432 143 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SPINT2O43291 252 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CTXN2P0C2S0 81 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR4E1P0C645 316 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 AADACP22760 399 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CD34P28906 385 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF134P52741 427 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ARPC4P59998 168 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LY6EQ16553 131 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LTC4SQ16873 150 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MORN2Q502X0 79 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TREML4Q6UXN2 200 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF596Q8TC21 504 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 C5orf30Q96GV9 206 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 AGMATQ9BSE5 352 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.5□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A0B4J2A0 478 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 YPEL1O60688 119 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2A4O95047 310 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PAX6P26367 422 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 FCGR2CP31995 323 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 DYNLT3P51808 116 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 KRTAP10-3P60369 221 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SSX2Q16385 188 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LYG2Q86SG7 212 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PIFOQ8TCI5 191 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LEAP2Q969E1 77 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 YPEL2Q96QA6 119 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2A7Q96R45 310 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PHB2Q99623 299 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 RDH8Q9NYR8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TCF19Q9Y242 345 aa8.49□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ITGB1BP1O14713 200 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 RGS13O14921 159 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PROP1O75360 226 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC22A5O76082 557 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PPYP01298 95 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGLV1-47P01700 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGLV2-14P01704 120 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IGHV3-7P01780 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZBTB25P24278 435 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 HTR1DP28221 377 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CEACAM6P40199 344 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 Q3ZCU0 254 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.48□□□□□ -1.05
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