RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF205O95201 554 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FBP1P09467 338 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SCTP09683 121 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 BCL2P10415 239 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DAOP14920 347 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 GCH1P30793 250 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CFHR2P36980 270 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TFF3Q07654 80 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF154Q13106 437 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HERPUD1Q15011 391 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MSMO1Q15800 293 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HAGHQ16775 308 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 RARRES2Q99969 163 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CENPEQ02224 2701 aa8.04□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPE3 182 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SYNGR2O43760 224 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 RHBDL1O75783 438 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 LY86O95711 162 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 OPN1MWP04001 364 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PGA5P0DJD9 388 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 RND2P52198 227 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF787Q6DD87 383 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HES4Q9HCC6 221 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 NOTCH2Q04721 2471 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GV50 99 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CLDN34H7C241 214 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R2P9O14990 202 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SOX15O60248 233 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MBP02144 154 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ADH4P08319 380 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PAX9P55771 341 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 BSPH1Q075Z2 132 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ELOBQ15370 118 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 Q6P435 159 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 LILRB2Q8N423 598 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 GPR146Q96CH1 333 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 AGMATQ9BSE5 352 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MSL2Q9HCI7 577 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MIOXQ9UGB7 285 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 VAX2Q9UIW0 290 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FZR1Q9UM11 496 aa8.03□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00587B1AMM8 73 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 SHISA9B4DS77 424 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 CDIPTO14735 213 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM50AO95807 157 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 EPHA1P21709 976 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 CEBPGP53567 150 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 CCL20P78556 96 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 RUNX1Q01196 453 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF146Q15072 292 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 PDCD1Q15116 288 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 ADIPOQQ15848 244 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 ATP6V1FQ16864 119 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf17Q53FE4 359 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF525Q8N782 197 aa8.02□□□□□ -1.13
POLR1A-208ENST00000486964 Q8WTZ3 238 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms