RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 THRSPQ92748 146 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PTX4Q96A99 478 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 AK3Q9UIJ7 227 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JLM5 398 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 H0Y980 276 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 MYL12BO14950 172 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 CNIH1O95406 144 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV12-3P01733 135 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 APOA2P02652 100 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 MED14OSP0DP75 135 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB25P24278 435 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TTC23Q5W5X9 447 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 AHSA2Q719I0 299 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PDPNQ86YL7 162 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 SETD9Q8NE22 299 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PHYHIPQ92561 330 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TMED9Q9BVK6 235 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBA4BQ9H853 241 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF221Q9UK13 617 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CXorf65A6NEN9 183 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R1X1 148 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SOCS1O15524 211 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 BPNT1O95861 308 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV2-23P01705 113 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CSN3P07498 182 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 GNAO1P09471 354 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SCTP09683 121 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CD37P11049 281 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 DYRK1AQ13627 763 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RY14Q15391 338 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9N2K0 584 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYGBP07316 175 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 AADACP22760 399 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LCN12Q6JVE5 192 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N402 240 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 BVESQ8NE79 360 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RDH8Q9NYR8 311 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 HSF4Q9ULV5 492 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 HERC1Q15751 4861 aa7.13□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TRDCB7Z8K6 153 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2A4O95047 310 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 UCHL1P09936 223 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 APELAP0DMC3 54 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 SRMP19623 302 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS7P47929 136 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 RPEL1Q2QD12 228 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf30Q96GV9 206 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 USMG5Q96IX5 58 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 HARBI1Q96MB7 349 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM68Q96MH6 324 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 GFI1Q99684 422 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 COA4Q9NYJ1 87 aa7.12□□□□□ -1.27
SMARCE1-210ENST00000481231 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.12□□□□□ -1.27
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