RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475553.1

USP37-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 37, human

TSL 4

Gene USP37, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP37-208	ENST00000475553	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ARL9	Q6T311	187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	COMTD1	Q86VU5	262 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LRP11	Q86VZ4	500 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SLC38A4	Q969I6	547 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	YIPF5	Q969M3	257 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	EMC6	Q9BV81	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		A0A0G2JMP0	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553		A0A0X1KG70	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	HMGN4	O00479	90 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RBBP9	O75884	186 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TACSTD2	P09758	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	AQP2	P41181	271 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MXD1	Q05195	221 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	BAMBI	Q13145	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	COTL1	Q14019	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CCL17	Q92583	94 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	OR52E6	Q96RD3	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	DOK1	Q99704	481 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
USP37-208	ENST00000475553	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.34	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	C5orf58	C9J3I9	102 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	SLC22A1	O15245	554 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	IFI6	P09912	130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	CBR1	P16152	277 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	DCK	P27707	260 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	GRPR	P30550	384 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	ARR3	P36575	388 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	HTR2B	P41595	481 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	CDKN2C	P42773	168 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	CLDN8	P56748	225 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	NAA20	P61599	178 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	NCALD	P61601	193 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	TSPAN5	P62079	268 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	H3F3A	P84243	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	PMS2P3	Q13401	168 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	SAXO2	Q658L1	398 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	STX12	Q86Y82	276 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	LRRC18	Q8N456	261 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	FRZB	Q92765	325 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	MAL2	Q969L2	176 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	OR51M1	Q9H341	326 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	GID8	Q9NWU2	228 aa		3.33	□□□□□ -1.88
USP37-208	ENST00000475553	MED29	Q9NX70	200 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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