RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473584.1

SCP2-208, Transcript of sterol carrier protein 2, human

TSL 2

Gene SCP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCP2-208	ENST00000473584	UBE2L6	O14933	153 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	HLA-DQB2	P05538	268 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	COQ5	Q5HYK3	327 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR51I2	Q9H344	312 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TUBA4B	Q9H853	241 aa		2.58	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	NACAD	O15069	1562 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584		H3BPC8	53 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TGOLN2	O43493	480 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	NDUFB2	O95178	105 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CRHBP	P24387	322 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CTBP2	P56545	445 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C1orf195	Q5TG92	126 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		2.57	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR6C6	A6NF89	314 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	DISC1	C4P0D8	188 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	SOD1	P00441	154 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CALB1	P05937	261 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GZMB	P10144	247 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GZMH	P20718	246 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CRYBB3	P26998	211 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	RSU1	Q15404	277 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	SBSN	Q6UWP8	590 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GID4	Q8IVV7	300 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OPTN	Q96CV9	577 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584		A0A1B0GW54	56 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM235	A6NFC5	223 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	IFNA5	P01569	189 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV1-69	P01742	117 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	UCHL3	P15374	230 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GNA12	Q03113	381 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584		J3QRE1	110 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	KCNK1	O00180	336 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	APOM	O95445	188 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CCL3	P10147	92 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	SERPINB10	P48595	397 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	RGS21	Q2M5E4	152 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR10K2	Q6IF99	312 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR52B2	Q96RD2	323 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C16orf95	Q9H693	158 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	COL18A1	P39060	1754 aa		2.54	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584		A0A0J9YX75	114 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR11H12	B2RN74	326 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	REG1A	P05451	166 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CCR7	P32248	378 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	SLCO1A2	P46721	670 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	CEBPG	P53567	150 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	TCL1A	P56279	114 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	DAND5	Q8N907	189 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	OR11H2	Q8NH07	326 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SCP2-208	ENST00000473584	PLCH2	O75038	1416 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SCP2-208	ENST00000473584	EVC2	Q86UK5	1308 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SCP2-208	ENST00000473584	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SCP2-208	ENST00000473584	OR5K4	A6NMS3	321 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SCP2-208	ENST00000473584	ODF3B	A8MYP8	253 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SCP2-208	ENST00000473584	GABRA4	P48169	554 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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