RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 IMPA1P29218 277 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 UGT2B10P36537 528 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 CDKN2CP42773 168 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 DAPP51397 102 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 CCL23P55773 120 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 MLF1P58340 268 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 SELENOWP63302 87 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 SLC35A2P78381 396 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 DEFB103AP81534 67 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 IL5RAQ01344 420 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 FADDQ13158 208 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 TAL2Q16559 108 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 IMPG1Q17R60 797 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 SPIN4Q56A73 249 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO48Q5FWF7 155 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 TTC32Q5I0X7 151 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 C6orf183Q5T699 404 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 NOXRED1Q6NXP6 359 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 FAHD1Q6P587 224 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 CLEC19AQ6UXS0 136 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 TMEM25Q86YD3 366 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 HS3ST5Q8IZT8 346 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 C10orf111Q8N326 155 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 S100ZQ8WXG8 99 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 C20orf144Q9BQM9 153 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 SLC7A11Q9UPY5 501 aa1.26□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF682O95780 498 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 CSTAP01040 98 aa1.25□□□□□ -2.21
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PTPRC-208ENST00000427110 IFI6P09912 130 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRC-208ENST00000427110 TFPTP0C1Z6 253 aa1.25□□□□□ -2.21
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