RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 RBKSQ9H477 322 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR35Q9HC97 309 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PP11 408 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BP45 60 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CTDSPLO15194 276 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAM20O43506 726 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PATE4P0C8F1 98 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF735P0CB33 412 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A1P53007 311 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGFBP7Q16270 282 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8B2Q96RD0 313 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNG5Q9UF02 275 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MARCH11A6NNE9 402 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 A8MWV9 139 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HLA-DQB1P01920 261 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FCGR3AP08637 254 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CA6P23280 308 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PMELP40967 661 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PDPNQ86YL7 162 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PNKDQ8N490 385 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5R1Q8NH85 324 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM140Q9NV12 185 aa3.83□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C7orf66A4D0T2 115 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2G10O15496 165 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL2P13500 99 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXA5P20719 270 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RY4P51582 365 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GGTLC2Q14390 218 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OTPQ5XKR4 325 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FAHD1Q6P587 224 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OTOSQ8NHW6 89 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MRAP2Q96G30 205 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 AICDAQ9GZX7 198 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A22Q9H936 323 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HSF4Q9ULV5 492 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NPTNQ9Y639 398 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 GBF1Q92538 1859 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD11O94819 623 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 S1PR2O95136 353 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFC2O95298 119 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ONECUT2O95948 504 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 UMODP07911 640 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF2P09038 288 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL2P10415 239 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LCN2P80188 198 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R1AQ13522 171 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF24Q7RTU0 167 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 C7orf71A4D174 169 aa3.82□□□□□ -1.8
ANKRD28-202ENST00000412318 K7ENP7 123 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms