RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG5Q15238 335 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNIH2Q6PI25 160 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCN1O00602 326 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTHLHP12272 177 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB8P28062 276 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A1P30531 599 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 VBP1P61758 197 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLGLAQ15195 96 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF695Q8IW36 515 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIABLOQ9NR28 239 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 THBS3P49746 956 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CX3CL1P78423 397 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 GVQW1Q8N7I0 195 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDB2Q92466 427 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QRK9 145 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV2-23P01705 113 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DQB1P01920 261 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLL1P15814 213 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECSCRQ19T08 205 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOGA1Q86XE5 327 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 BVESQ8NE79 360 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEST4Q8NFU0 473 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00473A8K010 186 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 XRCC3O43542 346 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A17O43808 307 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUSC2O75896 110 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA2P00918 260 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV1-40P01703 118 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM177Q53S58 311 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 HARBI1Q96MB7 349 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCC1Q96S66 551 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RX4Q99571 388 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABARAPO95166 117 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV2-14P01704 120 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYCNOSP40205 109 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC4P59998 168 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL8BQ17RB0 113 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB136Q30KP8 78 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAPC3Q92966 411 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAX2Q96IS3 184 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUX3Q96PT4 197 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK15Q9H2R5 256 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX15O60248 233 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCER2P06734 321 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYGBP07316 175 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R20P59543 309 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTF1Q16619 201 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM69Q5SWH9 247 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRASP10301 218 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX5P45973 191 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms