RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 TMEM18Q96B42 140 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ACY3Q96HD9 319 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CYYR1Q96J86 154 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CADP27708 2225 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ITGB1BP1O14713 200 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SOCS1O15524 211 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CA6P23280 308 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ALDH3B1P43353 468 aa8.57□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TAF9Q16594 264 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.57□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 SIAH2O43255 324 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TCF21O43680 179 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM50BP56557 158 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GNG3P63215 75 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PMS2P11Q13670 270 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM189A2Q15884 450 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 VHLLQ6RSH7 139 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DUSP13Q9UII6 198 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SPG11Q96JI7 2443 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 ZNF732B4DXR9 585 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PPP5D1E7EU14 171 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 HSPA12AO43301 675 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SPACA5Q96QH8 159 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 HSF4Q9ULV5 492 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FZR1Q9UM11 496 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 DIRAS3O95661 229 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 HPRT1P00492 218 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM225BP0DP42 221 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR3A4PP47883 348 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GPM6AP51674 278 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IL13RA2Q14627 380 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ASCL4Q6XD76 172 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PPQ1 181 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.55□□□□□ -1.04
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GINS3-201ENST00000318129 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R46P59540 309 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR5I1Q13606 314 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MSMPQ1L6U9 139 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 LRP11Q86VZ4 500 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MKXQ8IYA7 352 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PKIBQ9C010 78 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PLK3Q9H4B4 646 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 LRP5LA4QPB2 252 aa8.54□□□□□ -1.04
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