RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CALYQ9NYX4 217 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM189A5PLL7 270 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA2O43678 99 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM8Q96KF7 97 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 JPT1Q9UK76 154 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNB2O15031 1838 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PTGDSP41222 190 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM30BQ3MIR4 351 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 WNT5BQ9H1J7 359 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IL17BQ9UHF5 180 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 J3QW42 95 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 CCL21O00585 134 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 NAT2P11245 290 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 UCNP55089 124 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 Q5BKY6 102 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH11A6NNE9 402 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COX6A1P12074 109 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR4B1Q8NGF8 309 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PMCHL1Q16048 86 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PRR7Q8TB68 274 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM171Q8WVE6 324 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SFXN3Q9BWM7 321 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35B1P78383 322 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA5Q8N114 240 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 PCOLCEQ15113 449 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 MPTX1A8MV57 137 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM78Q5T7P6 136 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL1Q9BW60 279 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 PGPA6NDG6 321 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC5O15389 551 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CTSBP07858 339 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA2AP08913 450 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf88P0DMB2 117 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM54Q969K7 222 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 AGAP20933 346 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 STARD6P59095 220 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SPSB2Q99619 263 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SPSB4Q96A44 273 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA3A0PJX4 238 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SFTPCP11686 197 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 RND2P52198 227 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 THY1P04216 161 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF708P17019 499 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 RELBQ01201 579 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TWIST1Q15672 202 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TP53RKQ96S44 253 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 RARRES2Q99969 163 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZG16O60844 167 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 HTN1P15515 57 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 HCP5Q6MZN7 132 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 PILRBQ9UKJ0 227 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 K7ERU9 68 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 MAS1LP35410 378 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 STPG3Q8N7X2 389 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 FGF11Q92914 225 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 FAM106CPP0CH98 169 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BGRL3Q9H299 93 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 OR51M1Q9H341 326 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 SVILO95425 2214 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 TCF19Q9Y242 345 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 LOXL3P58215 753 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CEP290O15078 2479 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQM1 296 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CTSSP25774 331 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF738Q8NE65 137 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 S1PR2O95136 353 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 NPBWR2P48146 333 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 NMUP48645 174 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 GPHA2Q96T91 129 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PR77 199 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 M0R3E3 92 aa18.09■□□□□ 0.49
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-8O15522 239 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms