RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ZNF721Q8TF20 911 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 APCSP02743 223 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MYOD1P15172 320 aa6.75□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TCL1AP56279 114 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 P2RY1P47900 373 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 FAM27E3Q08E93 113 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 SPACA5Q96QH8 159 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 CT62P0C5K7 136 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 KIAA0040Q15053 153 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 KHDC3LQ587J8 217 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 FAM221AA4D161 298 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CTAG2O75638 210 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 HLA-GP17693 338 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ROM1Q03395 351 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 ZP4Q12836 540 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 TM4SF20Q53R12 229 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 BIVMQ86UB2 503 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 VSTM2LQ96N03 204 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 KCNK15Q9H427 330 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.74□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 COX5BP10606 129 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 CCL2P13500 99 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 AGAP20933 346 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.73□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 EGR1P18146 543 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 PRDX2P32119 198 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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USP3-201ENST00000268049 ASB10Q8WXI3 467 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 VGLL1Q99990 258 aa6.73□□□□□ -1.33
USP3-201ENST00000268049 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.73□□□□□ -1.33
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