RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-208ENST00000618318 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 OR10C1Q96KK4 312 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ITPR3Q14573 2671 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 A0A1B0GW55 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 E5RGE8 158 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 WRBO00258 174 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TOR1AO14656 332 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.371e-7■■□□□ 13.7
RPRD1B-208ENST00000618318 WIPF1O43516 503 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TSC22D2O75157 780 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 MED6O75586 246 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LY86O95711 162 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 HPRT1P00492 218 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 IFNA7P01567 189 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 RBP4P02753 201 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LYNX1P0DP58 116 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 RRASP10301 218 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 MMP9P14780 707 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LPAR6P43657 344 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 AKR1C2P52895 323 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 S100A10P60903 97 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ERVK-16P61578 105 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 GNB2P62879 340 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 OPCMLQ14982 345 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 NDUFA5Q16718 116 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 Q5BKY6 102 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TMUB2Q71RG4 321 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LINC00311Q8N616 119 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 SLC35G3Q8N808 338 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DCUN1D4Q92564 292 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TNFRSF14Q92956 283 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 AGMATQ9BSE5 352 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ARL6Q9H0F7 186 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PRR13Q9NZ81 148 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUX4Q9UBX2 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 NSG2Q9Y328 171 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 NF1P21359 2839 aa6.5□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 C17orf98A8MV24 154 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 G3V3Q6 166 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 M0R1X1 148 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 OVOL3O00110 214 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 TAAR5O14804 337 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 GPR137BO60478 399 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 SCGB1D2O95969 90 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 IGLV2-14P01704 120 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LIPFP07098 398 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LYL1P12980 280 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 OMGP23515 440 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 CDKN1AP38936 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ERVFRD-1P60508 538 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 VAMP2P63027 116 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 IL15RAQ13261 267 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 RAB32Q13637 225 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF273Q14593 569 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 AVPI1Q5T686 147 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 GPR157Q5UAW9 335 aa6.49□□□□□ -1.37
RPRD1B-208ENST00000618318 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.49□□□□□ -1.37
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