RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 AARDQ4LEZ3 155 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 FOXB1Q99853 325 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 VAMP8Q9BV40 100 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RNF114Q9Y508 228 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 B4GALT1P15291 398 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PCOLCEQ15113 449 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 Q6P435 159 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GGNQ86UU5 652 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 EPOPA6NHQ4 379 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GJE1A6NN92 205 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SERF1AO75920 110 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 LGALS4P56470 323 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MORN2Q502X0 79 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TCF23Q7RTU1 214 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR1L1Q8NH94 360 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TMEM45BQ96B21 275 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SLC35E1Q96K37 410 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 IL36BQ9NZH7 164 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ITGB1BP1O14713 200 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CBR3O75828 277 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 NEK7Q8TDX7 302 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PATE4P0C8F1 98 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ATP5G3P48201 142 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GTF3C1Q12789 2109 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 FGFRL1Q8N441 504 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C11orf52Q96A22 123 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 LRRC30A6NM36 301 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RNF212BA8MTL3 300 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SIAH2O43255 324 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CHRNB4P30926 498 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GPM6AP51674 278 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C5orf30Q96GV9 206 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RNF2Q99496 336 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DERL1Q9BUN8 251 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PKIBQ9C010 78 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SYT13Q7L8C5 426 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 BATF2Q8N1L9 274 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DRAM1Q8N682 238 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C9JCJ5 164 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CCL3P10147 92 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CDKN1BP46527 198 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 VEGFBP49765 207 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CST9LP1Q5W188 147 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.31□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SYNGR1O43759 233 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GPX1P07203 203 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR10J4P0C629 311 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PSG7Q13046 419 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR5I1Q13606 314 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RAET1LQ5VY80 246 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZS52 159 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DTD1Q8TEA8 209 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 K7EN84 100 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 NDUFB4O95168 129 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CLDN1O95832 211 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 IGLC2P0DOY2 106 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms