RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CDK10Q15131 360 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PLET1Q6UQ28 207 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR8H3Q8N146 312 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM86BQ8N661 226 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR5R1Q8NH85 324 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR1L1Q8NH94 360 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GPX8Q8TED1 209 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TOMM40LQ969M1 308 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RAB18Q9NP72 206 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF221Q9UK13 617 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PSG11Q9UQ72 335 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 FAM172BPA6NC97 362 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PLA2G10O15496 165 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV1-47P01700 117 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 SCTP09683 121 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 SLC6A1P30531 599 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ECI1P42126 302 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GPR12P47775 334 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GNG10P50151 68 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TSPAN5P62079 268 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 BAMBIQ13145 260 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 KLRD1Q13241 179 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 MORN2Q502X0 79 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ABHD1Q96SE0 405 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RDH8Q9NYR8 311 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ST8SIA5O15466 376 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LANCL1O43813 399 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 SSX5O60225 188 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA7O95182 113 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OPN1MWP04001 364 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 GSTT2P0CG29 244 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 FAM106CPP0CH98 169 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 OR5H8P0DN80 308 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 NAT1P18440 290 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RAB13P51153 203 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 DYNLT3P51808 116 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF137PP52743 207 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RAG2P55895 527 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 MSMO1Q15800 293 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf88Q6PI97 169 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 LYG1Q8N1E2 194 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms