RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 MPC2O95563 127 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 OMGP23515 440 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1C2P52895 323 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF273Q14593 569 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM71F2Q6NXP2 309 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LYZL2Q7Z4W2 148 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf62Q8N4C0 152 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 AGMATQ9BSE5 352 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR13Q9NZ81 148 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SESN1Q9Y6P5 492 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa18.64■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GU03 582 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2F2O95006 317 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIAL4GP0DN37 164 aa18.64■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 OR2F1Q13607 317 aa18.64■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 TCF23Q7RTU1 214 aa18.64■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR9G1Q8NH87 305 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10C1Q96KK4 312 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MFFQ9GZY8 342 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 IFI27L2Q9H2X8 130 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf98A8MV24 154 aa18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 ARPC5O15511 151 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 RRASP10301 218 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LPAR6P43657 344 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVK-16P61578 105 aa18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF787Q6DD87 383 aa18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DCUN1D4Q92564 292 aa18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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CAPNS1-212ENST00000591041 WRBO00258 174 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF224P0DH78 156 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL3L1P16619 93 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CT45A1Q5HYN5 189 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4S2Q8NH73 311 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1S1Q8NH92 325 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA4P78363 2273 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 E5RGE8 158 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R1W7 72 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6HO94772 140 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1D2O95969 90 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 HPRT1P00492 218 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1-8P0DP01 117 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 COL8A1P27658 744 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 SSTR2P30874 369 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A11P31949 105 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DUTP33316 252 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 GNG10P50151 68 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 RTL8BQ17RB0 113 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF439Q8NDP4 499 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 GRPEL2Q8TAA5 225 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LHFPL5Q8TAF8 219 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM133Q9H2Q1 129 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHA2Q9HB19 425 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD2Q9UBB5 411 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NSG2Q9Y328 171 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP24Q9Y5R2 645 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ENSAO43768 121 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 APOA2P02652 100 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 BTNL3Q6UXE8 466 aa18.59■□□□□ 0.57
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