RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00311Q8N616 119 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ENKURQ8TC29 256 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 GALMQ96C23 342 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD7Q96MP8 289 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR4F4Q96R69 305 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NICN1Q9BSH3 213 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PRELID1Q9Y255 219 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ALG5Q9Y673 324 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 V9GY05 133 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A2O00624 439 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD5O14737 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SOCS1O15524 211 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TXNL1O43396 289 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RGS11O94810 467 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OPN1MWP04001 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 AMY1AP04745 511 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 AMY2AP04746 511 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PF4V1P10720 104 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CTRB1P17538 263 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CHATP28329 748 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF134P52741 427 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN12P56749 244 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 UNC119Q13432 240 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TATDN3Q17R31 274 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MORN2Q502X0 79 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HES5Q5TA89 166 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MZT2AQ6P582 158 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 GAPTQ8N292 157 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CYYR1Q96J86 154 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TM2D1Q9BX74 207 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 JPT1Q9UK76 154 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB11A5LHX3 300 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FGF16O43320 207 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LYRM1O43325 122 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 YPEL1O60688 119 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MOSP00540 346 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CD1BP29016 333 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TALDO1P37837 337 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 VEGFCP49767 419 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 QRFPP83859 136 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HTD2P86397 168 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 GNMTQ14749 295 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CLLU1Q5K131 121 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TEX261Q6UWH6 196 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 YPEL2Q96QA6 119 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CITED4Q96RK1 184 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 GFI1Q99684 422 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 AK3Q9UIJ7 227 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 U3KQ87 197 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PLXNB1O43157 2135 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TGP01266 2768 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A6YYD4 124 aa6.6□□□□□ -1.35
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