RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF714Q96N38 554 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 PRR7Q8TB68 274 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 DHRS7CA6NNS2 312 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 CEACAM18A8MTB9 384 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 RABAC1Q9UI14 185 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 DMRTA1Q5VZB9 504 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 OR10S1Q8NGN2 331 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 H0YL77 283 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 EMP1P54849 157 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 SPANXN1Q5VSR9 72 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 TRGC1P0CF51 173 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 NHLRC3Q5JS37 347 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.42■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.41■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 H7C2G1 150 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF735P0CB33 412 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 CCL8P80075 99 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF502Q8TBZ5 544 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 RECKO95980 971 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 PCM1Q15154 2024 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 OR52M1Q8NGK5 317 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 SCN3AQ9NY46 2000 aa18.41■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM189A5PLL7 270 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 RARRES2Q99969 163 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 AQP10Q96PS8 301 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-211ENST00000580170 ADIPOQQ15848 244 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 B4E171 279 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 ID1P41134 155 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN7P41732 249 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DQA1P01909 254 aa18.39■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 LPAR2Q9HBW0 351 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 CTAG1AP78358 180 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 COL4A1P02462 1669 aa18.39■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF826PQ6ZT77 177 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM136Q6ZRR5 245 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A7PA6NKC0 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A22PA8MWA6 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A12PA8MX19 464 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A15PP0C7V4 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A13PP0C7W8 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A14PP0C7W9 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM90A24PP0C7X0 464 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 A8MWL6 223 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00869P0C866 280 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf66Q9H5L9 145 aa18.38■□□□□ 0.53
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