RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558566.1

TINF2-208, Transcript of TERF1 interacting nuclear factor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TINF2, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566		M0R1X1	148 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	DEDD	O75618	318 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	OR2F2	O95006	317 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	PET100	P0DJ07	73 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	C4BPB	P20851	252 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	CATR1	Q13166	79 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	OR2F1	Q13607	317 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	MSMO1	Q15800	293 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566		A0A0D9SG52	128 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	AKR1C2	P52895	323 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566		Q6ZRM9	215 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SNAPC5	O75971	98 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	S1PR2	O95136	353 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2	1e-8	■■■□□ 15
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF345	Q14585	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RAB1C	Q92928	201 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	FSTL3	O95633	263 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RLN2	P04090	185 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	RAB7A	P51149	207 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	DLX6	P56179	175 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	G6PC	P35575	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	DLX1	P56177	255 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TINF2-208	ENST00000558566	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	BCL2L11	O43521	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	SPDEF	O95238	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	KRAS	P01116	189 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	HKR1	P10072	659 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	RAB29	O14966	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	FCGR3B	O75015	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	HTR2B	P41595	481 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	SSSCA1	O60232	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TINF2-208	ENST00000558566	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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