RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ODAMA1E959 279 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHG3P01860 377 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CECR9P0C854 216 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCL2P10415 239 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 LTC4SQ16873 150 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.74■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR5H1A6NKK0 313 aa16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXC12P31275 282 aa16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR13A1Q8NGR1 328 aa16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL10A1Q03692 680 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALKBH2Q6NS38 261 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 OOEPA6NGQ2 149 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF212BA8MTL3 300 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC35E4Q6ICL7 350 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBD3L1Q8WWY6 194 aa16.72■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 LINC00473A8K010 186 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 AP4M1O00189 453 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ST8SIA5O15466 376 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLN5O75503 358 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFNA17P01571 189 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CXXC4Q9H2H0 198 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSPB7Q9UBY9 170 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZG16O60844 167 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 P0C879 139 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 NINJ1Q92982 152 aa16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087WWC5 75 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC30A6NM36 301 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEBPZOSA8MTT3 80 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 YIF1AO95070 293 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 COX5AP20674 150 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 EDDM3AQ14507 147 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF674Q2M3X9 581 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM41BQ5BJD5 291 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERF2P84101 59 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACSM6Q6P461 480 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 C1QL4Q86Z23 238 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFB124Q8NES8 71 aa16.7■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 S100A8P05109 93 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFA4P12838 97 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q3ZCU0 254 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSG11Q9UQ72 335 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM90A26D6RGX4 464 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYB5BO43169 146 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-13P01766 116 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-7P01780 117 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM6P0DI80 62 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD177Q8N6Q3 437 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIT2Q9NQR4 276 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP250Q9BV73 2442 aa16.69■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSX3Q99909 188 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC25A22Q9H936 323 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRBP23467 1997 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 EGR1P18146 543 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFF3Q07654 80 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSMPQ1L6U9 139 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB34Q8NCN2 500 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LHX4Q969G2 390 aa16.68■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CATR1Q13166 79 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSMO1Q15800 293 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRP11Q86VZ4 500 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 DTD1Q8TEA8 209 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC29Q8WV35 223 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC39A9Q9NUM3 307 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 HCFC1P51610 2035 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 PMS2P5A8MQ11 134 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF737O75373 536 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 GATAD1Q8WUU5 269 aa16.67■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 AQP7O14520 342 aa16.66■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KITLGP21583 273 aa16.66■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCH1P30793 250 aa16.66■□□□□ 0.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NDUFA6P56556 154 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms