RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 ITGB1BP1O14713 200 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SLC31A2O15432 143 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RGS11O94810 467 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 IGHV3-7P01780 117 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MSMBP08118 114 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MMP9P14780 707 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CD34P28906 385 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ZNF134P52741 427 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 DLX1P56177 255 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 FXYD4P59646 89 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ARF6P62330 175 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 BAMBIQ13145 260 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 LEAP2Q969E1 77 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TOMM40LQ969M1 308 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 AGMATQ9BSE5 352 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SIRPDQ9H106 197 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 GPR132Q9UNW8 380 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 KPTNQ9Y664 436 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.55□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PPE2 198 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PPE3 182 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PR64 198 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PRV1 198 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 B4DSR2 109 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 OR8U9P0C7N5 309 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PGAM2P15259 253 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 GYPEP15421 78 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PRTN3P24158 256 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 GNRHRP30968 328 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 GNG10P50151 68 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PAX8Q06710 450 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 Q3ZCU0 254 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 HCP5Q6MZN7 132 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZNX1 250 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 OR8U1Q8NH10 309 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ZNF596Q8TC21 504 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TNFRSF14Q92956 283 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 OR2D2Q9H210 308 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PSG11Q9UQ72 335 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.54□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TACC2O95359 2948 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 A0A0B4J293 547 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 VGLL3A8MV65 326 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 J3QR06 171 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 PEX14O75381 377 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 IGLV2-14P01704 120 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RLN1P04808 185 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RAB7AP51149 207 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RAG2P55895 527 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 RAB25P57735 213 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 MSMO1Q15800 293 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.53□□□□□ -1.36
BEST3-211ENST00000552295 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms