RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	PECR	Q9BY49	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A0A6YYD4	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1B0GW55	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	VCY	O14598	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CTDSPL	O15194	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SPINT2	O43291	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	YPEL1	O60688	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	FCGR3B	O75015	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	RGS11	O94810	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PAH	P00439	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	FSHB	P01225	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CD3G	P09693	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	S100A5	P33763	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TGFBR1	P36897	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ETV6	P41212	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	IER3	P46695	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	GLIPR1	P48060	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PRRX1	P54821	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ARF6	P62330	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	HMGN3	Q15651	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	AANAT	Q16613	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459		Q8N7P7	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	GALM	Q96C23	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459		Q9N2K0	584 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ZBTB25	P24278	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	NPBWR1	P48145	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	EFNB2	P52799	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ACTG1	P63261	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB5B-209	ENST00000551459	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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