RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 Q8N2B8 174 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 MCFD2Q8NI22 146 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 ZNF747Q9BV97 191 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 OR2D2Q9H210 308 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 RNF150Q9ULK6 438 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-224ENST00000551155 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 H7C2Y5 167 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CTDSP2O14595 271 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PEX14O75381 377 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 OR5H8P0DN80 308 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 NAT1P18440 290 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PROK1P58294 105 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 TAS2R46P59540 309 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 BLCAPP62952 87 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CBX3Q13185 183 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CDK10Q15131 360 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 LAX1Q8IWV1 398 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 GPX8Q8TED1 209 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 BORCS5Q969J3 196 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RNF5Q99942 180 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ZNF702PQ9H963 129 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 M0R1X1 148 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RBBP9O75884 186 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 APOA2P02652 100 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CT45A6P0DMU7 189 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CT45A5P0DMU8 189 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 CT45A7P0DMV0 189 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RRASP10301 218 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 FCGR2CP31995 323 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 S100A5P33763 92 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RCVRNP35243 200 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 THBS3P49746 956 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ACTBP60709 375 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 Q8N6K4 173 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 SNAPC3Q92966 411 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MMP27Q9H306 513 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 KIAA1456Q9P272 454 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 COL6A5A8TX70 2615 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 H0YJW9 148 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 GABARAPH6UMI1 98 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PROP1O75360 226 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 TUSC2O75896 110 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PPYP01298 95 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 AMY1AP04745 511 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 AMY2AP04746 511 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 FCER2P06734 321 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 HERV-K104P61576 105 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 DYRK1AQ13627 763 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 IL18Q14116 193 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MMDQ15546 238 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 MSMO1Q15800 293 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 RTL8BQ17RB0 113 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ACTBL2Q562R1 376 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 PDPNQ86YL7 162 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 Q8N9W7 124 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-224ENST00000551155 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms