RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.6□□□□□ -0.23
PACS1-208ENST00000529677 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.6□□□□□ -0.23
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PACS1-208ENST00000529677 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.6□□□□□ -0.23
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PACS1-208ENST00000529677 IGLV2-14P01704 120 aa13.58□□□□□ -0.24
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PACS1-208ENST00000529677 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.56□□□□□ -0.24
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PACS1-208ENST00000529677 SECTM1Q8WVN6 248 aa13.56□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 TOMM40LQ969M1 308 aa13.56□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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PACS1-208ENST00000529677 HSD17B6O14756 317 aa13.55□□□□□ -0.24
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PACS1-208ENST00000529677 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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PACS1-208ENST00000529677 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 MZT2BQ6NZ67 158 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 C17orf50Q8WW18 174 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 S1PR3Q99500 378 aa13.55□□□□□ -0.24
PACS1-208ENST00000529677 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.55□□□□□ -0.24
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