RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TCF23Q7RTU1 214 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FAM58AQ8N1B3 248 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SYS1Q8N2H4 156 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF596Q8TC21 504 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FGGYQ96C11 551 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OPALINQ96PE5 141 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4F4Q96R69 305 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF702PQ9H963 129 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 DPM3Q9P2X0 92 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TGP01266 2768 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4C45A6NMZ5 311 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 M0QZK8 103 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SOCS3O14543 225 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV1-47P01700 117 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 HTR1AP08908 422 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC159P0C7I6 412 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OCM2P0CE71 109 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 BRS3P32247 399 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CEACAM3P40198 252 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR3A1P47881 315 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 NPBWR2P48146 333 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 POU3F4P49335 361 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PAX5Q02548 391 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 EDDM3AQ14507 147 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TP53I3Q53FA7 332 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LCE1EQ5T753 118 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PET117Q6UWS5 81 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RDH10Q8IZV5 341 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 NDNFQ8TB73 568 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PELI1Q96FA3 418 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 Q96MT0 163 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 NOTCH1P46531 2555 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM212A6NML5 194 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LEUTXA8MZ59 168 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 J3QLW9 94 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 EI24O14681 340 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SULT1B1O43704 296 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SAP30O75446 220 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR2H2O95918 312 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV1D-12P01611 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF44P15621 663 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF19P17023 458 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 BCL3P20749 454 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CDK2P24941 298 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PAX6P26367 422 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PTGFRP43088 359 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 KCNJ3P48549 501 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RAB13P51153 203 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PRRX1P54821 245 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SLC34A1Q06495 639 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 SCN1BQ07699 218 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RAB40BQ12829 278 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ELP2Q6IA86 826 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 BATF2Q8N1L9 274 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 PXT1Q8NFP0 134 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4D6Q8NGJ1 314 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 C4orf36Q96KX1 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 CHST6Q9GZX3 395 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-225ENST00000515835 A0A087WZ39 114 aa4.71□□□□□ -1.66
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