RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPAN15	O95858	294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	ELK1	P19419	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	HPGDS	O60760	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	CBX5	P45973	191 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8N9W7	124 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131		H0YJW9	148 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MC5R	P33032	325 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR12	P47775	334 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	RITA1	Q96K30	269 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BMQ9	156 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TUSC2	O75896	110 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHG2	P01859	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	F2RL1	P55085	397 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACTB	P60709	375 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPPP	O94811	219 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NAT1	P18440	290 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRSS3	P35030	304 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOX6	P35712	828 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00205	P59089	165 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPB	Q8NG41	125 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA3	O95167	84 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF5	Q99942	180 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R1X1	148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTDSP2	O14595	271 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBBP9	O75884	186 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARPC4	P59998	168 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MMD	Q15546	238 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP2-223	ENST00000512131	SULT1C2	O00338	296 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	NBR2	O15453	112 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	PEX14	O75381	377 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCER2	P06734	321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNTFR	P26992	372 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	DDB2	Q92466	427 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23

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