RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 SGCZQ96LD1 299 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 G3V4G9 280 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 H3BMH7 237 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPYP01298 95 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CEACAM5P06731 702 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SPINK2P20155 84 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KITLGP21583 273 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CD38P28907 300 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CA7P43166 264 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF77Q15935 545 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CARD17Q5XLA6 110 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 WDR73Q6P4I2 378 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ASCL4Q6XD76 172 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 Q96M66 194 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ALG1L2C9J202 215 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf94C9JXX5 98 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 K7EN84 100 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SNAI2O43623 268 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ADH1BP00325 375 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGFBP4P22692 258 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CTSSP25774 331 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CD1BP29016 333 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF90Q03938 601 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RBPJQ06330 500 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FOXL1Q12952 345 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 VASH2Q86V25 355 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OCC1Q8TAD7 63 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 KCNK17Q96T54 332 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OBP2AQ9NY56 170 aa7.26□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 hDV102S1A0JD36 115 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 GJE1A6NN92 205 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM250H0YL14 139 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZNHIT1O43257 154 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR7C2O60412 319 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CD99P14209 185 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SSTR5P35346 364 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PAX2Q02962 417 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CT55Q8WUE5 264 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LYRM4Q9HD34 91 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 THYN1Q9P016 225 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087X0K7 114 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PP55 124 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1D-12P01611 117 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ECI1P42126 302 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TFF3Q07654 80 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PMCHL1Q16048 86 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CFAP161Q6P656 301 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR4S2Q8NH73 311 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR1L1Q8NH94 360 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TSKUQ8WUA8 353 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 JMJD8Q96S16 334 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.25□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IFNA1P01562 189 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SCTP09683 121 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGLC1P0CG04 106 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 AZU1P20160 251 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 LTBRP36941 435 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 GABRA2P47869 451 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TCL1AP56279 114 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FOXL2P58012 376 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MED12LQ86YW9 2145 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR51H1Q8NH63 302 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DDIT4LQ96D03 193 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FGF22Q9HCT0 170 aa7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms