RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPE3	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MXK9	166 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BET1	O15155	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFB3	O43676	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA2	O43678	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFB6	O95139	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP9	P14780	707 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGR2C	P31995	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RANBP1	P43487	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBX5	P45973	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPY4R	P50391	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R19	P59542	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTB	P60709	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTG1	P63261	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCN2	P80188	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LTC4S	Q16873	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q5PR19	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACAN	P16112	2415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCRB	P04435	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNASE1	P24855	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNRHR	P30968	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB25	P57735	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAMBI	Q13145	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLRD1	Q13241	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORN2	Q502X0	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNKD	Q8N490	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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