RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490808.1

HDAC3-210, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-210ENST00000490808 OR10C1Q96KK4 312 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CCL13Q99616 98 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 OR2D2Q9H210 308 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CALYQ9NYX4 217 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MBD2Q9UBB5 411 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CLN8Q9UBY8 286 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 METRNQ9UJH8 293 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 GAB2Q9UQC2 676 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 NSG2Q9Y328 171 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ACANP16112 2415 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MTORP42345 2549 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 C15orf65H3BRN8 121 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ADAM20O43506 726 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 BCL2L11O43521 198 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MMP9P14780 707 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 GPR12P47775 334 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 DSCR9P59020 149 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 KRTAP10-9P60411 292 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 VAMP2P63027 116 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 IL15RAQ13261 267 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RAB32Q13637 225 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MST1LQ2TV78 715 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 Q3ZCU0 254 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MORN2Q502X0 79 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SPRNQ5BIV9 151 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 GPR157Q5UAW9 335 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 DRAM1Q8N682 238 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 OR51H1Q8NH63 302 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RAB1CQ92928 201 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 K7EPK0 472 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 TNFSF12O43508 249 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 DEDDO75618 318 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SCGB1D2O95969 90 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 DAOP14920 347 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SSTR5P35346 364 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ARHGDIBP52566 201 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 AKR1C2P52895 323 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 OR1S1Q8NH92 325 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RFESDQ8TAC1 157 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 NEUROG1Q92886 237 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 AQP10Q96PS8 301 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PRR13Q9NZ81 148 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PSG11Q9UQ72 335 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.055e-8■■■■□ 25.9
HDAC3-210ENST00000490808 ZANQ9Y493 2812 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 A0A1W2PPE2 198 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 A0A1W2PR64 198 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 A0A1W2PRV1 198 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RAB29O14966 203 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 GPR137BO60478 399 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MED6O75586 246 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LY86O95711 162 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SOD3P08294 240 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CGB3P0DN86 165 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CGB7P0DN87 165 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 S100A1P23297 94 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 P2RY1P47900 373 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 FAM201AQ5SY85 155 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 OR8H3Q8N146 312 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF714Q96N38 554 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 S1PR3Q99500 378 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 RNF126Q9BV68 326 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 MIOXQ9UGB7 285 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-210ENST00000490808 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.48□□□□□ -1.05
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