RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RAMP3O60896 148 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SYNGR4O95473 234 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 QRFPP83859 136 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 UNC119Q13432 240 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NNATQ16517 81 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 Q6ZWC4 215 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 STARD4Q96DR4 205 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TSSK2Q96PF2 358 aa6.51□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR5B21A6NL26 309 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GNG7O60262 68 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CDKN1AP38936 164 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 LINC00310P59036 64 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM186Q96B77 213 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DDIT4LQ96D03 193 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CLN8Q9UBY8 286 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SEC16AO15027 2179 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ACACBO00763 2458 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HBE1P02100 147 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CSNK1A1P48729 337 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RAB9AP51151 201 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GFRALQ6UXV0 394 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF738Q8NE65 137 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ATP6V0BQ99437 205 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PLK3Q9H4B4 646 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MS4A18H0YCH9 400 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TYMSP04818 313 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ATP6V0CP27449 155 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF92Q03936 586 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IL13RA2Q14627 380 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF74Q16587 644 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 REEP6Q96HR9 211 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 VAMP8Q9BV40 100 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC6AO75865 159 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 AGFG2O95081 481 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MPZL1O95297 269 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ASCL1P50553 236 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RAB11AP62491 216 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF266Q14584 549 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SGCBQ16585 318 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 BSXQ3C1V8 233 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR10D3Q8NH80 312 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 AMELYQ99218 206 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 Q9N2K0 584 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 FAM166BA8MTA8 275 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NTF4P34130 210 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CDSNQ15517 529 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
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