RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35E1Q96K37 410 aa13.81□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PROK2Q9HC23 129 aa13.81□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MSMO1Q15800 293 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK14Q6IE38 97 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 APH1AQ96BI3 265 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DERL1Q9BUN8 251 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RNF150Q9ULK6 438 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DIRC3C9JPN6 131 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FCN1O00602 326 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 AMTP48728 403 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM105Q8N8V8 129 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RAB40CQ96S21 281 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR51B6Q9H340 312 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A20A6NK97 555 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GDF1P27539 372 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZWC4 215 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD3Q8WU67 409 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC16Q96DE5 110 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 A0A096LPE4 126 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPZ6 126 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IER3P46695 156 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IL11RAQ14626 422 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA45Q537H7 98 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 R4GN57 208 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZRM9 215 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PSMF1Q92530 271 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPSB1Q96BD6 273 aa13.79□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TNFSF13O75888 250 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KRASP01116 189 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF32P17041 273 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 AAED1Q7RTV5 226 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL5AQ8N109 375 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DECR2Q9NUI1 292 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NAPSAO96009 420 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1D-33P01593 117 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-33P01594 117 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 VHLLQ6RSH7 139 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF525Q8N782 197 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR5D13Q8NGL4 314 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TCFL5Q9UL49 500 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS20P59510 1910 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPV4 95 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 F6UZH7 168 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HTD2P86397 168 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 VASH2Q86V25 355 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 STPG4Q8N801 248 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZIC4Q8N9L1 334 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FGFBP3Q8TAT2 258 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HES7Q9BYE0 225 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.78□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC17A3O00476 420 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DKK1O94907 266 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 RANP62826 216 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NMSQ5H8A3 153 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 EDDM3BP56851 147 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM56Q96MV1 263 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CBR3O75828 277 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCL1P22362 96 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 F2RP25116 425 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE1Q13065 139 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00696Q6ZRV3 163 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NABP1Q96AH0 204 aa13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.8 ms