RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478693.1

SRRT-211, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-211ENST00000478693 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 GABARAPH6UMI1 98 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 H7C2Y5 167 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OR2F2O95006 317 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MOSP00540 346 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 IFNA6P05013 189 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 AADACP22760 399 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 DGCR2P98153 550 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CBX3Q13185 183 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 PYDC2Q56P42 97 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MDFIQ99750 246 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 AGMATQ9BSE5 352 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 BATF3Q9NR55 127 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 KLK11Q9UBX7 282 aa9.12□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OR5H14A6NHG9 310 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TUSC2O75896 110 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SLC22A5O76082 557 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 PPYP01298 95 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 NAT1P18440 290 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RFX2P48378 723 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TAS2R19P59542 299 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MMDQ15546 238 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 Q6ZSV7 163 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 BEX1Q9HBH7 125 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.11□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZFHX3Q15911 3703 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TMEM89A2RUT3 159 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 M0QYG6 137 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 M0QZK8 103 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CTDSPLO15194 276 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 PEX14O75381 377 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 NDUFA7O95182 113 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CSF1P09603 554 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CT45A6P0DMU7 189 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CT45A5P0DMU8 189 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CT45A7P0DMV0 189 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 MC5RP33032 325 aa9.1□□□□□ -0.95
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SRRT-211ENST00000478693 RELBQ01201 579 aa9.1□□□□□ -0.95
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SRRT-211ENST00000478693 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 FBLN7Q53RD9 439 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 AWAT1Q58HT5 328 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 KIAA1456Q9P272 454 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.1□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 H0YJW9 148 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TNFSF12O43508 249 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RAB3DO95716 219 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CD3DP04234 171 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TBPP20226 339 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 INPP1P49441 399 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RTL8BQ17RB0 113 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 KCTD9Q7L273 389 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 PDPNQ86YL7 162 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 ZNF383Q8NA42 475 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.09□□□□□ -0.95
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SRRT-211ENST00000478693 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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SRRT-211ENST00000478693 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 GAB2Q9UQC2 676 aa9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRRT-211ENST00000478693 CUBNO60494 3623 aa9.08□□□□□ -0.96
SRRT-211ENST00000478693 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.08□□□□□ -0.96
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