RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 NABP2Q9BQ15 211 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 CCDC32Q9BV29 185 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 ZNF221Q9UK13 617 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 OR5H14A6NHG9 310 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 J3QRK9 145 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 ZNF846Q147U1 533 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 MSMO1Q15800 293 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 DRAM1Q8N682 238 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 SSMEM1Q8WWF3 244 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 S1PR3Q99500 378 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 SSX3Q99909 188 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 CLDN34H7C241 214 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 AMY2AP04746 511 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 IFNA6P05013 189 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 CT45A6P0DMU7 189 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 CT45A5P0DMU8 189 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 CT45A7P0DMV0 189 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 RAB13P51153 203 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 FXYD4P59646 89 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 AP3S2P59780 193 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 HERV-K104P61576 105 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN5P62079 268 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 TRIQKQ629K1 86 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 TMEM86BQ8N661 226 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A0A6YYJ9 748 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 H3BUX3 64 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 M0R1X1 148 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 GNRHRP30968 328 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 BAMBIQ13145 260 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 TMEM17Q86X19 198 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CCL28Q9NRJ3 127 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SLC22A5O76082 557 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 VENTXO95231 258 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ARHGDIBP52566 201 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 UCP3P55916 312 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 LINC00205P59089 165 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 MOB3BQ86TA1 216 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ZNF383Q8NA42 475 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 OR5R1Q8NH85 324 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 TERB2Q8NHR7 220 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 TCF19Q9Y242 345 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 A6NDX4 124 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 DISC1C4P0D8 188 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 H0YJW9 148 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 TCF21O43680 179 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CD24P25063 80 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 BRS3P32247 399 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 EBI3Q14213 229 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-210ENST00000477812 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-210ENST00000477812 CHIAQ9BZP6 476 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CD1BP29016 333 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 BVESQ8NE79 360 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 PRRT1Q99946 306 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 LINC00473A8K010 186 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G10O15496 165 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 UBA52P62987 128 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.97■□□□□ 0.15
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