RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	NPFF	O15130	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CRLF1	O75462	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RGS11	O94810	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CEACAM6	P40199	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PRRX1	P54821	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	UCP3	P55916	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TAS2R46	P59540	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IL18	Q14116	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CDK10	Q15131	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	BAK1	Q16611	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731		Q8N402	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MMP28	Q9H239	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CLDN34	H7C241	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC31A2	O15432	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PLA2G10	O15496	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC22A5	O76082	557 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CD3D	P04234	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CSF1	P09603	554 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HTR1D	P28221	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	HRH1	P35367	487 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SAA4	P35542	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RFX2	P48378	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB7A	P51149	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	DLX1	P56177	255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TAS2R19	P59542	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	EBI3	Q14213	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GNMT	Q14749	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	PNKD	Q8N490	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	LHX4	Q969G2	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN12-209	ENST00000460731	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN12-209	ENST00000460731	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A1W2PPI3	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN12-209	ENST00000460731	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN12-209	ENST00000460731	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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