RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ZP3P21754 424 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 VEGFCP49767 419 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 ST3GAL4Q11206 333 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 SETD9Q8NE22 299 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 GGHQ92820 318 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 ABHD14BQ96IU4 210 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 CLCC1Q96S66 551 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 AGMATQ9BSE5 352 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 SPDEFO95238 335 aa20.2■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PSG5Q15238 335 aa20.2■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 TTC23Q5W5X9 447 aa20.2■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 EDARADDQ8WWZ3 215 aa20.2■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA25Q9BR10 227 aa20.2■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 H3BUA1 57 aa20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 OR10K2Q6IF99 312 aa20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 SETD6Q8TBK2 473 aa20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 TM2D1Q9BX74 207 aa20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 HYDINQ4G0P3 5121 aa20.19■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 HTR2CP28335 458 aa20.18■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 WNT4P56705 351 aa20.18■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.18■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.18■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 MYL12BO14950 172 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 ARSBP15848 533 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 CPEP16870 476 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB25P24278 435 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 POC5Q8NA72 575 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 CYGBQ8WWM9 190 aa20.17■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0G2JLM5 398 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 H0Y980 276 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 NICN1Q9BSH3 213 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa20.16■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 IGKV1-16P04430 117 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 CEACAM6P40199 344 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 UNC119Q13432 240 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 FXYD3Q14802 87 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PDPNQ86YL7 162 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PHYHIPQ92561 330 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.15■□□□□ 0.82
PBRM1-218ENST00000458294 PROP1O75360 226 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 HLA-DRB3P79483 266 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 OR9G4Q8NGQ1 327 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 PTX4Q96A99 478 aa20.14■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 APOA2P02652 100 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 HAGHQ16775 308 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF383Q8NA42 475 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF221Q9UK13 617 aa20.13■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A17O43808 307 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 IFNA6P05013 189 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 QRFPP83859 136 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 INSL4Q14641 139 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 OR5T1Q8NG75 326 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM68Q96MH6 324 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 KCNK15Q9H427 330 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 AK3Q9UIJ7 227 aa20.12■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 BRI3O95415 125 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 BPNT1O95861 308 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 IL34Q6ZMJ4 242 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 AHSA2Q719I0 299 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 GTSCR1Q86UQ5 136 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 C8orf4Q9NR00 106 aa20.11■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0A6YYD4 124 aa20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 CNIH1O95406 144 aa20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 AADACP22760 399 aa20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.1■□□□□ 0.81
PBRM1-218ENST00000458294 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms