RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 TSSK2Q96PF2 358 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 OR14A2Q96R54 314 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 OR8B4Q96RC9 309 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SULT4A1Q9BR01 284 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM208Q9BTX3 173 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 TTTY10Q9BZA0 68 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 GCM1Q9NP62 436 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0B4J2A0 478 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM212A6NML5 194 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 CEACAM18A8MTB9 384 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SEC14L6B5MCN3 397 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 KNG1P01042 644 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 H2BFMP0C1H6 154 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 MPZP25189 248 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SULT1A1P50225 295 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 MMP16P51512 607 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 RBX1P62877 108 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 DNLZQ5SXM8 178 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 BAP18Q8IXM2 172 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF664Q8N3J9 261 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 GJC3Q8NFK1 279 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 OR2Z1Q8NG97 314 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 OR1F12Q8NHA8 337 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 PELI1Q96FA3 418 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 KIRREL1Q96J84 757 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 FAM210BQ96KR6 192 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 PHOX2AO14813 284 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 DLEU1O43261 78 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO24O75426 580 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 CDAP32320 146 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 Q6YL49 198 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 NEK7Q8TDX7 302 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 RAB24Q969Q5 203 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SMIM8Q96KF7 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 OR2V2Q96R30 315 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 CITED1Q99966 193 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 M0R036 132 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BKO60814 126 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BOP23527 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BBP33778 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 PSMB10P40306 273 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BCP62807 126 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 ROM1Q03395 351 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 Q6ZR03 302 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf95Q9H693 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 MSL2Q9HCI7 577 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 COMMD9Q9P000 198 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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