RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 HNF4GQ14541 408 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OR52I2Q8NH67 350 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 EHFQ9NZC4 300 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 FABP12A6NFH5 140 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 GABARAPH6UMI1 98 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 TUSC2O75896 110 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 TSPAN9O75954 239 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 MOSP00540 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 PMP2P02689 132 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 CT45A6P0DMU7 189 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 CT45A5P0DMU8 189 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 CT45A7P0DMV0 189 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 HLA-DMAP28067 261 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 ACTBP60709 375 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 FBLN7Q53RD9 439 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 Q6ZSV7 163 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 BEX1Q9HBH7 125 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 A0A1B0GUS0 222 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 M0R1X1 148 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 CTDSPLO15194 276 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 PROP1O75360 226 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 SLC22A5O76082 557 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 AADACP22760 399 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 RFX2P48378 723 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 KLK11Q9UBX7 282 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 OR5H14A6NHG9 310 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 M0QZK8 103 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 MC5RP33032 325 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 HRH1P35367 487 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 DGCR2P98153 550 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 DYRK1AQ13627 763 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 AWAT1Q58HT5 328 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 C16orf95Q9H693 158 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-202ENST00000440447 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 A6NHS1 94 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 PPYP01298 95 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ACTBL2Q562R1 376 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 Q8N6K4 173 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SOSTQ9BQB4 213 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 COL6A5A8TX70 2615 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 H0YJW9 148 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 H7C2Y5 167 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 APOA2P02652 100 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 THBS3P49746 956 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 FXYD4P59646 89 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 HERV-K104P61576 105 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TSPAN5P62079 268 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 BLCAPP62952 87 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF383Q8NA42 475 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 LINC01006Q8NI28 216 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF702PQ9H963 129 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 FGF16O43320 207 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TBPP20226 339 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 LINC00205P59089 165 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 CCDC190Q86UF4 302 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 C5orf30Q96GV9 206 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 BATF3Q9NR55 127 aa14.56□□□□□ -0.08
PTX4-202ENST00000440447 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms