RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM27E3Q08E93 113 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 Q9N2K0 584 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 MOB3AQ96BX8 217 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 COL4A2P08572 1712 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF724A8MTY0 619 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TOX4O94842 621 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H3AP68431 136 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V1FQ16864 119 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 RSG1Q9BU20 258 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PSENENQ9NZ42 101 aa11.52□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 DEDDO75618 318 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ECI1P42126 302 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP161Q6P656 301 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 GALMQ96C23 342 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 GNG7O60262 68 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CECR9P0C854 216 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 F2RL1P55085 397 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 VAMP8Q9BV40 100 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5B21A6NL26 309 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 REG4Q9BYZ8 158 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 FCGR3BO75015 233 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TFPI2P48307 235 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF345Q14585 488 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NTNG2Q96CW9 530 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 METRNQ9UJH8 293 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR137BO60478 399 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB11AP62491 216 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 COL10A1Q03692 680 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 BAXQ07812 192 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CLN8Q9UBY8 286 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 HSF4Q9ULV5 492 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GV72 72 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 H0Y8G0 127 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EM74 188 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTDAPP60985 99 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 BAGE3Q86Y29 109 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 BAGE2Q86Y30 109 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 MDS2Q8NDY4 140 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 LOXL4Q96JB6 756 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 RARRES2Q99969 163 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ATMQ13315 3056 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DRB3P79483 266 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 DHODHQ02127 395 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 AWAT1Q58HT5 328 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 LRP5LA4QPB2 252 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 M0R1X1 148 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 FGF2P09038 288 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V0CP27449 155 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA2G5P39877 138 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM45BQ96B21 275 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 WFDC1Q9HC57 220 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2G2P60604 165 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 HERPUD1Q15011 391 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 CHODLQ9H9P2 273 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-210ENST00000437078 IRF2P14316 349 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms