RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPNP16150 400 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VAMP1P23763 118 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HTR1DP28221 377 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF134P52741 427 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF137PP52743 207 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LGALS4P56470 323 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACTBP60709 375 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACTG1P63261 375 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD83Q01151 205 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL18Q14116 193 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STPG2Q8N412 459 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MALSU1Q96EH3 234 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGMATQ9BSE5 352 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.354e-12■■■■□ 26.3
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCA1O95477 2261 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PRD5 423 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PRF3 423 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PRM7 423 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OOSP1A8MZH6 123 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC31A2O15432 143 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUSC2O75896 110 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV3-7P01780 117 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBP1P09467 338 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBPP20226 339 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEACAM3P40198 252 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNG10P50151 68 aa6.61□□□□□ -1.35
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAS2R46P59540 309 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MADCAM1Q13477 382 aa6.61□□□□□ -1.35
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q6YL49 198 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR52I2Q8NH67 350 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC6A7Q99884 636 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GHITMQ9H3K2 345 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RDH8Q9NYR8 311 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DPM3Q9P2X0 92 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MLXQ9UH92 298 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSPA12AO43301 675 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBBP9O75884 186 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHFRP00374 187 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FABP1P07148 127 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSF1P09603 554 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5H8P0DN80 308 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB4AP20338 218 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL3RAP26951 378 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEACAM6P40199 344 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DYNLT3P51808 116 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HILS1P60008 231 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DGCR2P98153 550 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BTN1A1Q13410 526 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF79Q15937 498 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACTBL2Q562R1 376 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.6□□□□□ -1.35
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.6□□□□□ -1.35
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