RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 OR2D2Q9H210 308 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 CTSZQ9UBR2 303 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087X0M5 115 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GU03 582 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GW55 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GX30 115 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 C17orf98A8MV24 154 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 CCSO14618 274 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RAB29O14966 203 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ADAP1O75689 374 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 GPR12P47775 334 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 GNMTQ14749 295 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SMCO1Q147U7 214 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF546Q86UE3 836 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SEC22AQ96IW7 307 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUX4Q9UBX2 424 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PSG11Q9UQ72 335 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB11Q9Y547 144 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DSCAMO60469 2012 aa8.07□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 L7N2F9 121 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RGS13O14921 159 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 MMP9P14780 707 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PAX1P15863 534 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DLX6P56179 175 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 Q5BKY6 102 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 NMSQ5H8A3 153 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35G3Q8N808 338 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 UBALD1Q8TB05 177 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 OR10C1Q96KK4 312 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 COA4Q9NYJ1 87 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFS8O00217 210 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ST8SIA3O43173 380 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF12O43508 249 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 FCN3O75636 299 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 S100A11P31949 105 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 THBS3P49746 956 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF273Q14593 569 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF585BQ52M93 769 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 OR51H1Q8NH63 302 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 S1PR3Q99500 378 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 RNF126Q9BV68 326 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 MFFQ9GZY8 342 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 PRR13Q9NZ81 148 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR1A-202ENST00000409024 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms