RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PTHLHP12272 177 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 GVQW1Q8N7I0 195 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2D2Q9H210 308 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 EXTL2Q9UBQ6 330 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RABL2BQ9UNT1 228 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 H7C2Y5 167 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R1X1 148 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RBBP9O75884 186 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 APOA2P02652 100 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A6P0DMU7 189 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A5P0DMU8 189 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A7P0DMV0 189 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5H8P0DN80 308 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R46P59540 309 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK10Q15131 360 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8N6K4 173 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF5Q99942 180 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RASL11BQ9BPW5 248 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MEIS3P1A6NDR6 274 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CBX3Q13185 183 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM131AQ6UXB0 335 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 GPX8Q8TED1 209 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA13Q9P0J0 144 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ANAPC10Q9UM13 185 aa12.25□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YJW9 148 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CTDSP2O14595 271 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 TUSC2O75896 110 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 AMY1AP04745 511 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 AMY2AP04746 511 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 NAT1P18440 290 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FCGR2CP31995 323 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RCVRNP35243 200 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 THBS3P49746 956 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTBP60709 375 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MMDQ15546 238 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FBLN7Q53RD9 439 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PDPNQ86YL7 162 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHDC1Q8N7A1 406 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5H2Q8NGV7 314 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MCFD2Q8NI22 146 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PLSCR3Q9NRY6 295 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SERTAD4Q9NUC0 356 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1456Q9P272 454 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 J3QRK9 145 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PROP1O75360 226 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FCER2P06734 321 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RRASP10301 218 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF645Q8N7E2 425 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8N9W7 124 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAPC3Q92966 411 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 BORCS5Q969J3 196 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CITED1Q99966 193 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 EHFQ9NZC4 300 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 NBR2O15453 112 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNAB3O43448 404 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 DYRK1AQ13627 763 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MSMO1Q15800 293 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RTL8BQ17RB0 113 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTBL2Q562R1 376 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZS46 218 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXRED2Q8IWF2 684 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 LAX1Q8IWV1 398 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF383Q8NA42 475 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.22□□□□□ -0.45
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