RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SYNGR1O43759 233 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00271P0C7V0 271 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM50BP56557 158 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 CSRP2Q16527 193 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 DRAM1Q8N682 238 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM230Q96A57 120 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 JKAMPQ9P055 326 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 BMPR1BO00238 502 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ASAH2BP0C7U1 165 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PSMB2P49721 201 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EFNB1P98172 346 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALNT1Q00973 533 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PDE6HQ13956 83 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM78BQ5VT40 261 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SNX22Q96L94 193 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 WDR13Q9H1Z4 485 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 POM121BA6NF01 834 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF785A8K8V0 405 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RAMP1O60894 148 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OPRM1P35372 400 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 SOSTQ9BQB4 213 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FFAR1O14842 300 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A28Q96A46 364 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TTTY10Q9BZA0 68 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP13Q9UII6 198 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ICOSLGO75144 302 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO45P0C2W1 286 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 HSD52Q0P140 79 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 STPG1Q5TH74 334 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GV50 99 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SNURFLB1AK76 121 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 K7ESF4 209 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ITGB1BP1O14713 200 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HYPMO75409 117 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM255AQ5JRV8 349 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf111Q8N326 155 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HSD17B8Q92506 261 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TBX15Q96SF7 602 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
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