RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 OR2A7Q96R45 310 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 C5orf30Q96GV9 206 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TUBA4BQ9H853 241 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ZAR1LA6NP61 321 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 WNT1P04628 370 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 P2RY4P51582 365 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 FOXC1Q12948 553 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MMP16P51512 607 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SYNGR3O43761 229 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CTAG2O75638 210 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TOMM40O96008 361 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PSMG4Q5JS54 123 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 IL20Q9NYY1 176 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 FOCADQ5VW36 1801 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 OTOSQ8NHW6 89 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 GPR146Q96CH1 333 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.69□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 KLK10O43240 276 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 NT5CQ8TCD5 201 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 DPRXA6NFQ7 191 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 LINC01565O15544 149 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 NDUFA3O95167 84 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 NEU3Q9UQ49 428 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SYNGR1O43759 233 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TNFSF14O43557 240 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 LINC00614P0C842 121 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SKP2Q13309 424 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CD3EP07766 207 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SCAND1P57086 179 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 UBE2FQ969M7 185 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SVIPQ8NHG7 77 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MPZL1O95297 269 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TMEM42Q69YG0 159 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 SDF2Q99470 211 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 GFYI3L273 518 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 AMER3Q8N944 861 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 POC1AQ8NBT0 407 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 FOXB1Q99853 325 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 J3QR06 171 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 NDUFB4O95168 129 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 HPRT1P00492 218 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CLDN10P78369 228 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 LINC00596Q86U02 117 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 PPP6CO00743 305 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 C18orf15Q96N68 181 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 JPT2Q9H910 190 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 B9D1Q9UPM9 204 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 ALG1L2C9J202 215 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 H0Y8X5 98 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 H0YIG0 161 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-201ENST00000288050 EMCNQ9ULC0 261 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms