RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WUU8	490 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CBY3	A6NI87	242 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SH2D1B	O14796	132 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PHOX2A	O14813	284 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SULT1B1	O43704	296 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX11A	O75192	247 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM4B	O94953	1096 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	APOC1	P02654	83 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CD14	P08571	375 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2H	P62256	183 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKCD	Q05655	676 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF146	Q15072	292 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R7	Q15435	360 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	STX1A	Q16623	288 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		Q9HAA7	133 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR13	Q9NZ81	148 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTPD6	O75354	484 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	NRAS	P01111	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TPM1	P09493	284 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKACA	P17612	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RASSF2	P50749	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKAA2	P54646	552 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN8	P56748	225 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2B8P	P59922	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PSG5	Q15238	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF79	Q15937	498 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		Q3ZCU0	254 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8IYB0	196 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CBR4	Q8N4T8	237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM239	Q8WW34	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MED31	Q9Y3C7	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BNG1	76 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RBBP9	O75884	186 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SULT1C4	O75897	302 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SRM	P19623	302 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB6	P28072	239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKN2C	P42773	168 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00310	P59036	64 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SCN1B	Q07699	218 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RIPK1	Q13546	671 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	STEAP3	Q658P3	488 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SSX9	Q7RTT3	188 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	STON2	Q8WXE9	905 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MAL2	Q969L2	176 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A096LPF7	62 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BNX3	289 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		H7C2Y5	167 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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