RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610369.4

TARDBP-211, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-211ENST00000610369 RAX2Q96IS3 184 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.58□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 RNF5Q99942 180 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 NICN1Q9BSH3 213 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.58□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.58□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.57□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.56□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.56□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 IGLV1-40P01703 118 aa7.56□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 RAB25P57735 213 aa7.56□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 RAB22AQ9UL26 194 aa7.56□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 VSIG4Q9Y279 399 aa7.56□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.56□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.56□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 G3V318 75 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 H0YJW9 148 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 H7C2Y5 167 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 RRHO14718 337 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 ATP6V0E1O15342 81 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 OR8U8P0C7N1 319 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 CNTFRP26992 372 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 CD40LGP29965 261 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 SERPINB10P48595 397 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 RAB9AP51151 201 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 FHL3Q13643 280 aa7.55□□□□□ -1.2
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TARDBP-211ENST00000610369 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 DEFB136Q30KP8 78 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 OR11H1Q8NG94 326 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 GFI1Q99684 422 aa7.55□□□□□ -1.2
TARDBP-211ENST00000610369 PECRQ9BY49 303 aa7.55□□□□□ -1.2
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