RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PRD5 423 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PRF3 423 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PRM7 423 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 BET1O15155 118 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 VENTXO95231 258 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-7P01780 117 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CD74P04233 296 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CEACAM6P40199 344 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ARHGDIBP52566 201 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ARPC4P59998 168 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DGCR2P98153 550 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CDK10Q15131 360 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MSMO1Q15800 293 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SSX2Q16385 188 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 GINS4Q9BRT9 223 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 GAB2Q9UQC2 676 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 PLXNB1O43157 2135 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PPE3 182 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB29O14966 203 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ST8SIA5O15466 376 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC22A5O76082 557 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV4-59P01825 116 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5H8P0DN80 308 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 BAMBIQ13145 260 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 LSAMPQ13449 338 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DYRK1AQ13627 763 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IL18Q14116 193 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 EBI3Q14213 229 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 LYG1Q8N1E2 194 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MFSD4AQ8N468 514 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DTX3Q8N9I9 347 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 C5orf30Q96GV9 206 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OCEL1Q9H607 264 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TCF19Q9Y242 345 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 A6NDX4 124 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 BTBD17A6NE02 478 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 FABP12A6NFH5 140 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5H14A6NHG9 310 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 H3BUX3 64 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TRIM77I1YAP6 450 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TIMM23O14925 209 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 PROP1O75360 226 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 PPYP01298 95 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CD1BP29016 333 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 BRS3P32247 399 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 HRH1P35367 487 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR3A3P47888 321 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N6K4 173 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MOB3AQ96BX8 217 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 S1PR3Q99500 378 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SSX3Q99909 188 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 NABP2Q9BQ15 211 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 CHIAQ9BZP6 476 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 SRRQ9GZT4 340 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 OR2D2Q9H210 308 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-221ENST00000591856 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms