RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB39BQ96DA2 213 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFSF12O43508 249 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLN5O75503 358 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FABP1P07148 127 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa20.29■□□□□ 0.84
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0R1B8 84 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2H2O95918 312 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF506Q5JVG8 444 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZR03 302 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CMTM1Q8IZ96 169 aa20.28■□□□□ 0.84
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.28■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.27■□□□□ 0.84
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NIT2Q9NQR4 276 aa20.27■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF727A8MUV8 499 aa20.27■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7ENP7 123 aa20.27■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPIHO43447 177 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBP1P09467 338 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TUBG1P23258 451 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F2RP25116 425 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM169BQ8N8A8 192 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLDND2Q8NHS1 167 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXXC4Q9H2H0 198 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WWC5 75 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TDGF1P3P51864 188 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAS2R30P59541 319 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV39A0A0B4J263 110 aa20.25■□□□□ 0.83
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR146Q96CH1 333 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WRBO00258 174 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNT9BO14905 357 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPPA3Q6W0C5 159 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRRG2O14669 202 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM27E3Q08E93 113 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF146Q15072 292 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF429Q86V71 674 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUSP13Q9UII6 198 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2W1Q9Y3N9 320 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WSB1Q9Y6I7 421 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH2D1BO14796 132 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TXNL1O43396 289 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEBPGP53567 150 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2KP61086 200 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HLA-DRB3P79483 266 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLK1P80370 383 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLE4Q04727 773 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC25A6P12236 298 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSMPQ1L6U9 139 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR51M1Q9H341 326 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GU03 582 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MDH2P40926 338 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPS10P46783 165 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELOBQ15370 118 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GFRALQ6UXV0 394 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRP11Q86VZ4 500 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8WTZ3 238 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BP45 60 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HAND1O96004 215 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSG2P11465 335 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF343Q6P1L6 599 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZRM9 215 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRR18Q8N4B5 295 aa20.22■□□□□ 0.83
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