RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM219	Q86XT9	240 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR9G1	Q8NH87	305 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MCFD2	Q8NI22	146 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PHF21A	Q96BD5	680 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	CMTM3	Q96MX0	182 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SSX3	Q99909	188 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.69	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PPE2	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PPI3	338 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PR64	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PRV1	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SERPINE3	A8MV23	424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TOR1A	O14656	332 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	RGS5	O15539	181 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LANCL1	O43813	399 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	APOA1	P02647	267 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LGALS4	P56470	323 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GNG2	P59768	71 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DGCR2	P98153	550 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HNF4G	Q14541	408 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DRAM1	Q8N682	238 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR52I2	Q8NH67	350 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR5R1	Q8NH85	324 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	CFHR4	Q92496	578 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GALM	Q96C23	342 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MMP28	Q9H239	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PALMD	Q9NP74	551 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DIABLO	Q9NR28	239 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	YPEL1	O60688	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TPPP	O94811	219 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PMP2	P02689	132 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HTR1D	P28221	377 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	TALDO1	P37837	337 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	RFX2	P48378	723 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PRRX1	P54821	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HTD2	P86397	168 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF45	Q02386	682 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HOGA1	Q86XE5	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	GPX8	Q8TED1	209 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MALSU1	Q96EH3	234 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	YPEL2	Q96QA6	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	RDH8	Q9NYR8	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	KLK11	Q9UBX7	282 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		A6NDX4	124 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566		M0QYG6	137 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	DTYMK	P23919	212 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	CNTFR	P26992	372 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	CD40LG	P29965	261 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	PRSS3	P35030	304 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ETV6	P41212	452 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF846	Q147U1	533 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TSC2-223	ENST00000568566	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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