RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ISPD	A4D126	451 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CLDN34	H7C241	214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2J3	O76001	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	FSTL3	O95633	263 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHM	P01871	453 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN1SW	P03999	348 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF32	P17041	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	MSR1	P21757	451 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	GZMM	P51124	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75	3e-7	■■■□□ 18.9
TMOD3-208	ENST00000560725	MTPN	P58546	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PPP1CB	P62140	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SELENOW	P63302	87 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	LCN2	P80188	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	IL18	Q14116	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PNKD	Q8N490	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CD1B	P29016	333 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	KDELR2	P33947	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	MPV17	P39210	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	RGS6	P49758	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	GLO1	Q04760	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PSG7	Q13046	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	BAMBI	Q13145	260 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725		Q6ZSR3	168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OAF	Q86UD1	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TMOD3-208	ENST00000560725	CUBN	O60494	3623 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	XKRY	O14609	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	RAB29	O14966	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SGCE	O43556	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CD14	P08571	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IFI30	P13284	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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