RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	F2RL2	O00254	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TOR1A	O14656	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MPPED1	O15442	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	YPEL1	O60688	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CAD	P27708	2225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GNRHR	P30968	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SSTR5	P35346	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DSCR9	P59020	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GNB2	P62879	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MSMO1	Q15800	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZPA2	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	S1PR3	Q99500	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067		H0Y980	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFS8	O00217	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TNFSF12	O43508	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RP2	O75695	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C1QB	P02746	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	RLN2	P04090	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LIPF	P07098	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	HOXB5	P09067	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PET100	P0DJ07	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SELL	P14151	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CXCL3	P19876	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	DNASE1	P24855	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	F2R	P25116	425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	IL3RA	P26951	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	SSTR2	P30874	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	PRRX1	P54821	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	MORN2	Q502X0	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATL1-208	ENST00000556067	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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