RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SPATS1Q496A3 300 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 ZNF529Q6P280 563 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 Q6ZWC4 215 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 GAPTQ8N292 157 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 FBXL17Q9UF56 701 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 ZAR1LA6NP61 321 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 HTR1AP08908 422 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 CCR9P51686 369 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 RIPK1Q13546 671 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 C6orf183Q5T699 404 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SNAPC3Q92966 411 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 RNF183Q96D59 192 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 PELI1Q96FA3 418 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 IL36GQ9NZH8 169 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 H3BNX3 289 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 H7C2Y5 167 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 IGKV1-16P04430 117 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 AADACP22760 399 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 MPV17LQ2QL34 196 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 TM4SF20Q53R12 229 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 STX19Q8N4C7 294 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 GHSRQ92847 366 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 METTL9Q9H1A3 318 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 NDE1Q9NXR1 346 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 MLXQ9UH92 298 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 JPT1Q9UK76 154 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 PPP5D1E7EU14 171 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 SLC22A1O15245 554 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 YPEL1O60688 119 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 PRH1P02810 166 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 MAS1P04201 325 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 RAB3AP20336 220 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 ATP6V1E1P36543 226 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 YPEL2Q96QA6 119 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 PRRG3Q9BZD7 231 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 COA4Q9NYJ1 87 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-230ENST00000551968 A0A0B4J203 849 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 OR5H14A6NHG9 310 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 E9PI62 339 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 J3QLW9 94 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 J3QRE1 110 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 SLC16A6O15403 523 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 PROP1O75360 226 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ZNF19P17023 458 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 RAB12Q6IQ22 244 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 LINC00596Q86U02 117 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 USMG5Q96IX5 58 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 UBE2QL1A1L167 161 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 IGLL5B9A064 214 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 RBBP9O75884 186 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 CBLN1P23435 193 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 SOX2P48431 317 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 HTD2P86397 168 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 SLC22A6Q4U2R8 563 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-230ENST00000551968 ORAI1Q96D31 301 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms